Statnett trenger en kraftig økning av gebyrinntekter forå dekke sine kostnader til å administrere ordningen (NECS), skriverSmåkraftforeninga.

I 2013 har engangsgebyret vært 30 øre/elsertifikat. Franyttår øker utstedelsesgebyret til40 øre.
Forskrift om elsertifikater legger til grunn at «De samlede gebyrer skaltilsvare de faktiske kostnader registeransvarlig har ved effektiv utvikling ogdrift av registeret i ordningens levetid.»